26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4360 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4360  palmitoyl transferase  100 
 
 
209 aa  433  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4079  palmitoyl transferase  87.26 
 
 
212 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3937  Antimicrobial peptide resistance and lipid A acylation PagP  77.06 
 
 
195 aa  288  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0182  Antimicrobial peptide resistance and lipid A acylation PagP  76.36 
 
 
166 aa  277  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0993  palmitoyl transferase  59.91 
 
 
197 aa  262  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1158  palmitoyl transferase  66.09 
 
 
191 aa  247  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0787  palmitoyl transferase  65.48 
 
 
186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0262451  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0669  palmitoyl transferase  65.48 
 
 
186 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00401694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0743  palmitoyl transferase  65.48 
 
 
186 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0683  palmitoyl transferase  65.48 
 
 
186 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0729  palmitoyl transferase  65.48 
 
 
186 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3003  Antimicrobial peptide resistance and lipid A acylation PagP  66.04 
 
 
186 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00581  hypothetical protein  66.04 
 
 
186 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0647  palmitoyl transferase  66.04 
 
 
186 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0674  palmitoyl transferase  66.04 
 
 
186 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000562202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00592  palmitoyl transferase for Lipid A  66.04 
 
 
186 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.814052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0711  palmitoyl transferase  66.04 
 
 
186 aa  236  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000134929  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3022  palmitoyl transferase  66.04 
 
 
186 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2570  palmitoyl transferase  55.77 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2476  palmitoyl transferase  54.07 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0639966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2380  palmitoyl transferase  51.61 
 
 
185 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1664  palmitoyl transferase  53.85 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325331  normal  0.194893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1009  palmitoyl transferase  41.67 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.026393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0865  palmitoyl transferase  41.67 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0170025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0025  palmitoyl transferase  39.77 
 
 
190 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0026  palmitoyl transferase  38.92 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>