26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0647 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3003  Antimicrobial peptide resistance and lipid A acylation PagP  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00592  palmitoyl transferase for Lipid A  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.814052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00581  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0711  palmitoyl transferase  99.46 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000134929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0674  palmitoyl transferase  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0647  palmitoyl transferase  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3022  palmitoyl transferase  99.46 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0787  palmitoyl transferase  76.34 
 
 		 186 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0262451  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0669  palmitoyl transferase  75.81 
 
 		 186 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00401694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0743  palmitoyl transferase  75.81 
 
 		 186 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0683  palmitoyl transferase  75.81 
 
 		 186 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0729  palmitoyl transferase  75.27 
 
 		 186 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1158  palmitoyl transferase  74.35 
 
 		 191 aa  302  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4079  palmitoyl transferase  67.5 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4360  palmitoyl transferase  66.04 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3937  Antimicrobial peptide resistance and lipid A acylation PagP  59.89 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0993  palmitoyl transferase  67.32 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0182  Antimicrobial peptide resistance and lipid A acylation PagP  64.71 
 
 		 166 aa  223  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2570  palmitoyl transferase  61.25 
 
 		 191 aa  208  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2476  palmitoyl transferase  53.7 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0639966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2380  palmitoyl transferase  53.7 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1664  palmitoyl transferase  53.46 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325331  normal  0.194893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1009  palmitoyl transferase  37.97 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.026393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0865  palmitoyl transferase  37.97 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0170025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0025  palmitoyl transferase  41.72 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0026  palmitoyl transferase  40.4 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>