30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4986 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4986  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 		 337 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1603  acetoin catabolism protein X  56.59 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3728  ATP-NAD/AcoX kinase  51.8 
 
 		 358 aa  318  7e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5549  ATP-NAD/AcoX kinase  52.05 
 
 		 357 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0938  hypothetical protein  47.29 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10270  hypothetical protein  47.59 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1038  ATP-NAD/AcoX kinase  43.54 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0341  acetoin catabolism protein AcoX  42.56 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1778  ATP-NAD/AcoX kinase  43.45 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2406  ATP-NAD/AcoX kinase  46.13 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00235302  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1751  ATP-NAD/AcoX kinase  42.86 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0513964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3761  ATP-NAD/AcoX kinase  41.16 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0595  ATP-NAD/AcoX kinase  44.88 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41720  ATP-NAD AcoX kinase  45.54 
 
 		 360 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0601  ATP-NAD/AcoX kinase  44.71 
 
 		 351 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0556  ATP-NAD/AcoX kinase  44.58 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5921  ATP-NAD/AcoX kinase  42.06 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1865  ATP-NAD/AcoX kinase  42.94 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319737  hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5142  ATP-NAD/AcoX kinase  42.65 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796219  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1841  ATP-NAD/AcoX kinase  42.65 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6238  ATP-NAD/AcoX kinase  42.65 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0886009  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1432  ATP-NAD/AcoX kinase  42.94 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353034  decreased coverage  0.000962833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0312  putative acetoin catabolism protein  41.89 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2031  ATP-NAD/AcoX kinase  33.63 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  38.78 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1090  ATP-NAD/AcoX kinase  37.72 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1697  ATP-NAD/AcoX kinase  36.68 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.24579  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2365  ATP-NAD/AcoX kinase  33.74 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0882785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1439  ATP-NAD/AcoX kinase  30.92 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0758  ATP-NAD/AcoX kinase  33.73 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>