30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5921 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5921  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
354 aa  701    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0312  putative acetoin catabolism protein  90.65 
 
 
354 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3761  ATP-NAD/AcoX kinase  81.02 
 
 
364 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1751  ATP-NAD/AcoX kinase  72.46 
 
 
352 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0513964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1432  ATP-NAD/AcoX kinase  75.43 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353034  decreased coverage  0.000962833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1778  ATP-NAD/AcoX kinase  71.59 
 
 
352 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5142  ATP-NAD/AcoX kinase  72.67 
 
 
385 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796219  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1865  ATP-NAD/AcoX kinase  72.83 
 
 
352 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319737  hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6238  ATP-NAD/AcoX kinase  72.38 
 
 
368 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0886009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1841  ATP-NAD/AcoX kinase  72.38 
 
 
368 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10270  hypothetical protein  50.29 
 
 
346 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0938  hypothetical protein  49.12 
 
 
346 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0601  ATP-NAD/AcoX kinase  46.78 
 
 
351 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0595  ATP-NAD/AcoX kinase  48.4 
 
 
351 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0556  ATP-NAD/AcoX kinase  48.4 
 
 
351 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1038  ATP-NAD/AcoX kinase  49.27 
 
 
348 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41720  ATP-NAD AcoX kinase  50.59 
 
 
360 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0341  acetoin catabolism protein AcoX  44.64 
 
 
360 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2406  ATP-NAD/AcoX kinase  48.07 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00235302  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5549  ATP-NAD/AcoX kinase  42.18 
 
 
357 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1603  acetoin catabolism protein X  42.18 
 
 
351 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4986  ATP-NAD/AcoX kinase  42.06 
 
 
337 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1090  ATP-NAD/AcoX kinase  41.89 
 
 
372 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2031  ATP-NAD/AcoX kinase  35.44 
 
 
332 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3728  ATP-NAD/AcoX kinase  40.06 
 
 
358 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  41.69 
 
 
341 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  normal  0.94631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2365  ATP-NAD/AcoX kinase  30.61 
 
 
339 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0882785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1697  ATP-NAD/AcoX kinase  34.15 
 
 
315 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.24579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1439  ATP-NAD/AcoX kinase  34.95 
 
 
339 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  26.76 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>