29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3761 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3761  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
364 aa  724    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5921  ATP-NAD/AcoX kinase  81.02 
 
 
354 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0312  putative acetoin catabolism protein  81.87 
 
 
354 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1751  ATP-NAD/AcoX kinase  72.29 
 
 
352 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0513964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1778  ATP-NAD/AcoX kinase  71.71 
 
 
352 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1432  ATP-NAD/AcoX kinase  73.79 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353034  decreased coverage  0.000962833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1865  ATP-NAD/AcoX kinase  72.96 
 
 
352 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319737  hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5142  ATP-NAD/AcoX kinase  72.78 
 
 
385 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796219  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6238  ATP-NAD/AcoX kinase  72.52 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0886009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1841  ATP-NAD/AcoX kinase  72.52 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10270  hypothetical protein  50 
 
 
346 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0938  hypothetical protein  48.85 
 
 
346 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0556  ATP-NAD/AcoX kinase  46.78 
 
 
351 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0601  ATP-NAD/AcoX kinase  46.78 
 
 
351 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0595  ATP-NAD/AcoX kinase  46.5 
 
 
351 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0341  acetoin catabolism protein AcoX  45.03 
 
 
360 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41720  ATP-NAD AcoX kinase  46.72 
 
 
360 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1038  ATP-NAD/AcoX kinase  45.82 
 
 
348 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2406  ATP-NAD/AcoX kinase  47.38 
 
 
337 aa  269  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00235302  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5549  ATP-NAD/AcoX kinase  40.4 
 
 
357 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1603  acetoin catabolism protein X  42.07 
 
 
351 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4986  ATP-NAD/AcoX kinase  41.16 
 
 
337 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1090  ATP-NAD/AcoX kinase  42.05 
 
 
372 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3728  ATP-NAD/AcoX kinase  39.19 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2031  ATP-NAD/AcoX kinase  35.1 
 
 
332 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  39.19 
 
 
341 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  normal  0.94631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2365  ATP-NAD/AcoX kinase  28.33 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0882785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1697  ATP-NAD/AcoX kinase  34.63 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.24579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1439  ATP-NAD/AcoX kinase  34.63 
 
 
339 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>