29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0556 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0556  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 		 351 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0601  ATP-NAD/AcoX kinase  96.3 
 
 		 351 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0595  ATP-NAD/AcoX kinase  98.58 
 
 		 351 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10270  hypothetical protein  76.33 
 
 		 346 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0938  hypothetical protein  75.67 
 
 		 346 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41720  ATP-NAD AcoX kinase  73.35 
 
 		 360 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5921  ATP-NAD/AcoX kinase  50.15 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3761  ATP-NAD/AcoX kinase  48.14 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1751  ATP-NAD/AcoX kinase  49.56 
 
 		 352 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0513964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1778  ATP-NAD/AcoX kinase  48.97 
 
 		 352 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5142  ATP-NAD/AcoX kinase  49.57 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796219  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1432  ATP-NAD/AcoX kinase  49.71 
 
 		 403 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353034  decreased coverage  0.000962833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0312  putative acetoin catabolism protein  49.27 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1865  ATP-NAD/AcoX kinase  49.41 
 
 		 352 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319737  hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1841  ATP-NAD/AcoX kinase  48.82 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6238  ATP-NAD/AcoX kinase  48.82 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0886009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5549  ATP-NAD/AcoX kinase  46.33 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1038  ATP-NAD/AcoX kinase  43.15 
 
 		 348 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2406  ATP-NAD/AcoX kinase  46.25 
 
 		 337 aa  255  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00235302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1603  acetoin catabolism protein X  44.05 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4986  ATP-NAD/AcoX kinase  44.58 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0341  acetoin catabolism protein AcoX  41.37 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1090  ATP-NAD/AcoX kinase  43.8 
 
 		 372 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3728  ATP-NAD/AcoX kinase  41.62 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2031  ATP-NAD/AcoX kinase  33.03 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  38.58 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  normal  0.94631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2365  ATP-NAD/AcoX kinase  33.04 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0882785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1697  ATP-NAD/AcoX kinase  35.03 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.24579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1439  ATP-NAD/AcoX kinase  32.53 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>