More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2417 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2417  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  97.73 
 
 		 115 aa  176  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  87.5 
 
 		 115 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  87.21 
 
 		 115 aa  159  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  87.21 
 
 		 115 aa  159  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  87.21 
 
 		 115 aa  159  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  86.05 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3710  IS66 Orf2 family protein  64.77 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4156  transposase, IS66 Orf2  63.64 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  60.23 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  60.23 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  61.36 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  55.81 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  61.63 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  55.81 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  59.21 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  48.98 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  53.85 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  53.85 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  48.98 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  53.85 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  53.85 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  53.85 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  53.85 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  53.85 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  52.33 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  54.12 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  51.16 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  51.16 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  51.16 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  51.16 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  52.94 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  52.94 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  52.94 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  52.94 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  52.94 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  50.65 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  52.94 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  53.49 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  52.33 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  52.33 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  51.76 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  51.16 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2108  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  57.69 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3168  putative IS66 transposase orf2, TnpB  56.41 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589585  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3595  IS66 Orf2 family protein  58.11 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  54.88 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>