11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1673 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1673  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0079  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2917  hypothetical protein  48.15 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3182  hypothetical protein  48.15 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1277  hypothetical protein  46.81 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.092151  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4470  hypothetical protein  42.5 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00680469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1415  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0967796  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3110  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396397  normal  0.0247031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0454  hypothetical protein  48.94 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2087  hypothetical protein  42.11 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0762  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>