11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3110 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3110  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396397  normal  0.0247031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2087  hypothetical protein  85.71 
 
 		 86 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0762  hypothetical protein  85.71 
 
 		 63 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1415  hypothetical protein  48.33 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0967796  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0079  hypothetical protein  48.28 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4470  hypothetical protein  40.35 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00680469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0454  hypothetical protein  38.1 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1673  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3182  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2917  hypothetical protein  43.64 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4077  hypothetical protein  31.15 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>