24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1834 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1834  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  810    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000164325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1847  stage II sporulation E family protein  44.36 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0317  stage II sporulation E family protein  36.08 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0557  protein serine/threonine phosphatase  35.07 
 
 		 379 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0656  stage II sporulation E family protein  33.16 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0091  protein serine/threonine phosphatase  33.67 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0838  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.151148  hitchhiker  0.00127176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01780  Serine/threonine specific protein phosphatase  33.83 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4047  protein serine/threonine phosphatase  33.67 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.448973  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2299  protein serine/threonine phosphatase  31.83 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1316  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.535038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1370  stage II sporulation E family protein  31.3 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3464  protein serine/threonine phosphatase  33.25 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02070  Stage II sporulation E family protein  35.33 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0427  serine phosphatase  30.98 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1584  stage II sporulation E family protein  33.61 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00248045  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0751  protein serine/threonine phosphatase  31.84 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.298345  hitchhiker  0.00000000000976918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0518  hypothetical protein  28.98 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000310896  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0493  stage II sporulation E family protein  31.43 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  27.52 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1283  protein serine/threonine phosphatase  29.05 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00412718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  23.92 
 
 		 851 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  21.28 
 
 		 663 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3169  protein serine/threonine phosphatase  24.77 
 
 		 238 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00870401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>