15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1414 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1414  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000639051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2208  putative lipoprotein  38.99 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2299  putative lipoprotein  32.35 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.340663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  33.53 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0752  hypothetical protein  31.41 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0767  hypothetical protein  31.41 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  32.5 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2437  hypothetical protein  30.06 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  25.57 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  29.03 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1732  putative lipoprotein  25 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2085  hypothetical protein  22.75 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.025196  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1426  putative lipoprotein  23.65 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0143558  normal  0.124121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1638  hypothetical protein  26.25 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0056  hypothetical protein  27.81 
 
 		 192 aa  44.3  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0125376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>