13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0752 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0752  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0767  hypothetical protein  96.45 
 
 		 174 aa  309  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  49.39 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2208  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2299  putative lipoprotein  37.87 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.340663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1732  putative lipoprotein  34.1 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1414  hypothetical protein  31.41 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000639051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  34.52 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2437  hypothetical protein  27.01 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132989  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0609  hypothetical protein  27.85 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  28.46 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2085  hypothetical protein  25.3 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.025196  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0727  hypothetical protein  26.06 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0156781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>