13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2208 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2208  putative lipoprotein  100 
 
 		 176 aa  355  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2299  putative lipoprotein  53.8 
 
 		 175 aa  195  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.340663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0752  hypothetical protein  45.16 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0767  hypothetical protein  44.52 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1414  hypothetical protein  39.38 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000639051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1732  putative lipoprotein  34.41 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  33.73 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2437  hypothetical protein  29.14 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  29.37 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2085  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.025196  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0727  hypothetical protein  31.19 
 
 		 197 aa  44.3  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0156781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0989  hypothetical protein  31.65 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>