85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3526 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3526  cell division protein FtsL  100 
 
 
106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03265  cell division protein FtsL  67.33 
 
 
111 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0114313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2651  cell division protein FtsL  40 
 
 
108 aa  83.6  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4472  cell division protein FtsL  41.24 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3818  cell division protein FtsL  39.05 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0403  cell division protein FtsL  37.62 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4540  cell division protein FtsL  37.62 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1986  cell division protein FtsL  40.82 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3460  cell division protein FtsL  34.65 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0347  cell division protein FtsL  39.8 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.465826  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004497  hypothetical protein  41.84 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00895  hypothetical protein  40.24 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0420  cell division protein FtsL  41.58 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000489235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0394  cell division protein FtsL  41.58 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0395  cell division protein FtsL  41.58 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0406  cell division protein FtsL  41.58 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3577  cell division protein FtsL  40.59 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.401048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4226  cell division protein FtsL  40.4 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0379  cell division protein FtsL  40.59 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3750  cell division protein FtsL  39.6 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000526991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0348  cell division protein, FtsL -like protein  33.33 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.697569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0603  cell division protein FtsL  41.05 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4519  cell division protein FtsL  52 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1330  cell division protein FtsL  52 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60348  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3394  cell division protein FtsL  37.89 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3525  cell division protein FtsL  37.89 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.100792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2925  cell division protein FtsL  37.89 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0480  cell division protein FtsL  38.61 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3811  cell division protein FtsL  33.33 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4394  cell division protein FtsL  50.67 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105943  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4415  cell division protein FtsL, putative  48.05 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3599  cell division protein FtsL  38.95 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4109  cell division protein FtsL  46.75 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0334939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0937  cell division protein FtsL  50.67 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0138  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3787  cell division protein FtsL  38.95 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0137  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0130  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0133  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0133  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000273113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3517  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3574  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507772  hitchhiker  0.000631421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0088  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.660147  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0076  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00083  hypothetical protein  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0091  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0085  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.811512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0089  cell division protein FtsL  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00084  membrane bound cell division protein at septum containing leucine zipper motif  35.79 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0754  cell division protein FtsL  36.84 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0641  cell division protein FtsL  39.33 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13180  cell division protein FtsL  45.33 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0762  cell division protein FtsL  41.03 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4680  cell division protein, FtsL-like  45.33 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0487302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0596  cell division protein FtsL  37.5 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.852855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0915  cell division protein FtsL  43.75 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265118  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2868  cell division protein, FtsL -like  37.33 
 
 
93 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2208  cell division protein FtsL  33.33 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.203384  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1140  cell division protein FtsL  34.21 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.036604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4991  cell division protein FtsL  43.94 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2459  cell division protein FtsL  36.99 
 
 
85 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57440  cell division protein FtsL  43.94 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0206  cell division protein FtsL  34.57 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1990  cell division protein  34.57 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0359124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2200  cell division protein FtsL  34.62 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.469837  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04373  cell division protein FtsL  28.75 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1975  cell division protein FtsL  32.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2276  cell division protein, FtsL -like protein  35.21 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.373522 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2054  cell division protein  32.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.81614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2621  cell division protein FtsL  35.14 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.808366  unclonable  0.00000000000370691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2731  cell division protein FtsL  35.62 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0629  cell division protein FtsL  34.74 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649015  normal  0.584625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3096  cell division protein FtsL  35.62 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2098  cell division protein FtsL  35.48 
 
 
90 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0213  cell division protein FtsL  28.24 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0392  cell division protein FtsL  28.24 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.217545 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0443  cell division protein FtsL  33.33 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3505  cell division protein, FtsL -like  35.9 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0841  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.65 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2501  cell division protein, FtsL-like  40.68 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.773445  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2197  cell division protein, FtsL -like protein  31.08 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2986  cell division protein, FtsL -like  36.62 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3434  cell division protein FtsL  36.71 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2435  cell division protein FtsL, putative  35.8 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2851  cell division FtsL transmembrane protein  31.51 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>