78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3460 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3460  cell division protein FtsL  100 
 
 
104 aa  207  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3818  cell division protein FtsL  83.65 
 
 
104 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0403  cell division protein FtsL  84.62 
 
 
104 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4540  cell division protein FtsL  81.73 
 
 
104 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0348  cell division protein, FtsL -like protein  73.79 
 
 
104 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.697569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0379  cell division protein FtsL  76.92 
 
 
104 aa  156  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3577  cell division protein FtsL  76.92 
 
 
104 aa  156  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.401048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3750  cell division protein FtsL  75.96 
 
 
104 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000526991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4226  cell division protein FtsL  74.04 
 
 
104 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0394  cell division protein FtsL  75 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0395  cell division protein FtsL  75 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0406  cell division protein FtsL  75 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0420  cell division protein FtsL  75 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000489235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0480  cell division protein FtsL  72.12 
 
 
104 aa  150  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0347  cell division protein FtsL  73.08 
 
 
103 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.465826  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3811  cell division protein FtsL  73.79 
 
 
104 aa  147  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00895  hypothetical protein  45.1 
 
 
105 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004497  hypothetical protein  47.06 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1986  cell division protein FtsL  46 
 
 
106 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3599  cell division protein FtsL  48.84 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03265  cell division protein FtsL  38.24 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0114313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2651  cell division protein FtsL  41.51 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3787  cell division protein FtsL  48.84 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3517  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0137  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0089  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0085  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.811512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00083  hypothetical protein  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3574  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507772  hitchhiker  0.000631421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0091  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0088  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.660147  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0130  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0138  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0076  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0133  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0133  cell division protein FtsL  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000273113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00084  membrane bound cell division protein at septum containing leucine zipper motif  48.78 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0641  cell division protein FtsL  47.67 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0603  cell division protein FtsL  46.51 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0754  cell division protein FtsL  41.67 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3525  cell division protein FtsL  42.71 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.100792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3394  cell division protein FtsL  42.71 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2925  cell division protein FtsL  42.71 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4472  cell division protein FtsL  39.18 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3526  cell division protein FtsL  34.65 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1140  cell division protein FtsL  42.67 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.036604  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0629  cell division protein FtsL  45.35 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649015  normal  0.584625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2868  cell division protein, FtsL -like  34.52 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04373  cell division protein FtsL  42.47 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2197  cell division protein, FtsL -like protein  36.05 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4415  cell division protein FtsL, putative  31.87 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4109  cell division protein FtsL  31.87 
 
 
97 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0334939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2208  cell division protein FtsL  33.75 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.203384  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1330  cell division protein FtsL  29.67 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60348  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4519  cell division protein FtsL  29.67 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4394  cell division protein FtsL  29.67 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105943  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0937  cell division protein FtsL  29.67 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2276  cell division protein, FtsL -like protein  35.14 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.373522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0596  cell division protein FtsL  36.99 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.852855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0915  cell division protein FtsL  29.17 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265118  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0351  cell division protein  30.53 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13180  cell division protein FtsL  36.49 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1975  cell division protein FtsL  38.27 
 
 
87 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4680  cell division protein, FtsL-like  34.25 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0487302 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2054  cell division protein  38.27 
 
 
87 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.81614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0841  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.52 
 
 
105 aa  47.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0762  cell division protein FtsL  33.75 
 
 
89 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2200  cell division protein FtsL  30.86 
 
 
91 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.469837  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0206  cell division protein FtsL  32.94 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1990  cell division protein  32.94 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0359124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2459  cell division protein FtsL  32.5 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4991  cell division protein FtsL  33.33 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57440  cell division protein FtsL  33.33 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3434  cell division protein FtsL  27.16 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19456  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2987  cell division protein FtsL  33.78 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3677  cell division protein FtsL  33.78 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.67489  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2501  cell division protein, FtsL-like  34.85 
 
 
105 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.773445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2435  cell division protein FtsL, putative  26.83 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>