78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3525 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3394  cell division protein FtsL  100 
 
 
105 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2925  cell division protein FtsL  100 
 
 
105 aa  204  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3525  cell division protein FtsL  100 
 
 
105 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.100792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0754  cell division protein FtsL  89.52 
 
 
106 aa  191  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3787  cell division protein FtsL  84.76 
 
 
105 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3599  cell division protein FtsL  82.86 
 
 
106 aa  180  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0603  cell division protein FtsL  81.9 
 
 
107 aa  173  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0641  cell division protein FtsL  80.95 
 
 
107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0130  cell division protein FtsL  76.7 
 
 
121 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0138  cell division protein FtsL  76.7 
 
 
121 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0137  cell division protein FtsL  76.7 
 
 
121 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0133  cell division protein FtsL  76.7 
 
 
121 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000273113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0133  cell division protein FtsL  76.7 
 
 
121 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0091  cell division protein FtsL  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0076  cell division protein FtsL  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0088  cell division protein FtsL  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.660147  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3574  cell division protein FtsL  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507772  hitchhiker  0.000631421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00083  hypothetical protein  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0085  cell division protein FtsL  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.811512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0089  cell division protein FtsL  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3517  cell division protein FtsL  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00084  membrane bound cell division protein at septum containing leucine zipper motif  75.24 
 
 
121 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0629  cell division protein FtsL  74.76 
 
 
121 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649015  normal  0.584625 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2651  cell division protein FtsL  45.54 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1986  cell division protein FtsL  41.67 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3460  cell division protein FtsL  42.71 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135005 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0351  cell division protein  41.58 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4540  cell division protein FtsL  40.2 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0348  cell division protein, FtsL -like protein  46.51 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.697569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3818  cell division protein FtsL  41.67 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0403  cell division protein FtsL  43.9 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00895  hypothetical protein  37.5 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004497  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0347  cell division protein FtsL  45.12 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.465826  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4226  cell division protein FtsL  54.17 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0379  cell division protein FtsL  51.43 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3577  cell division protein FtsL  51.43 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.401048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3750  cell division protein FtsL  50 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000526991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0420  cell division protein FtsL  49.3 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000489235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0394  cell division protein FtsL  49.3 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0395  cell division protein FtsL  49.3 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0406  cell division protein FtsL  49.3 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03265  cell division protein FtsL  36.63 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0114313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4472  cell division protein FtsL  39.58 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0480  cell division protein FtsL  50 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3811  cell division protein FtsL  45.71 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0915  cell division protein FtsL  41.77 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265118  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1140  cell division protein FtsL  40.54 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.036604  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3526  cell division protein FtsL  37.89 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2200  cell division protein FtsL  43.9 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.469837  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2276  cell division protein, FtsL -like protein  40.24 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.373522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13180  cell division protein FtsL  43.75 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4109  cell division protein FtsL  43.66 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0334939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4415  cell division protein FtsL, putative  42.25 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0762  cell division protein FtsL  37.97 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2197  cell division protein, FtsL -like protein  42.17 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0937  cell division protein FtsL  42.11 
 
 
97 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2459  cell division protein FtsL  41.56 
 
 
85 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4394  cell division protein FtsL  43.48 
 
 
97 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105943  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2435  cell division protein FtsL, putative  36.71 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4519  cell division protein FtsL  42.03 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4680  cell division protein, FtsL-like  40.58 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0487302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1330  cell division protein FtsL  42.03 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60348  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2208  cell division protein FtsL  32.95 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.203384  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4991  cell division protein FtsL  39.44 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2868  cell division protein, FtsL -like  42.31 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3434  cell division protein FtsL  32.14 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57440  cell division protein FtsL  38.03 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2851  cell division FtsL transmembrane protein  32.39 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3505  cell division protein, FtsL -like  38.67 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2731  cell division protein FtsL  30.77 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2986  cell division protein, FtsL -like  29.58 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3096  cell division protein FtsL  30.77 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2621  cell division protein FtsL  32.14 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.808366  unclonable  0.00000000000370691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0596  cell division protein FtsL  36.25 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.852855  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2501  cell division protein, FtsL-like  38.1 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.773445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0841  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.38 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0443  cell division protein FtsL  37.35 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.136863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>