20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1792 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1792  50S ribosomal protein L39e  100 
 
 		 51 aa  97.8  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0484601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0442  50S ribosomal protein L39e  94.12 
 
 		 51 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1678  50S ribosomal protein L39e  92.16 
 
 		 51 aa  90.9  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0986  50S ribosomal protein L39e  88.24 
 
 		 51 aa  89  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0202  ribosomal protein L39e  68 
 
 		 52 aa  66.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.768835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0791  50S ribosomal protein L39e  58 
 
 		 51 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.669936  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1516  50S ribosomal protein L39e  58 
 
 		 51 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.151323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1164  50S ribosomal protein L39e  60 
 
 		 51 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1159  50S ribosomal protein L39e  58 
 
 		 51 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1325  Ribosomal protein L39e  54.9 
 
 		 51 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.567616  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0026  Ribosomal protein L39e  50.98 
 
 		 51 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1569  50S ribosomal protein L39e  57.14 
 
 		 49 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1626  50S ribosomal protein L39e  52.94 
 
 		 51 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000120847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0472  ribosomal protein L39e  60 
 
 		 50 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0115  50S ribosomal protein L39e  47.73 
 
 		 51 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1970  50S ribosomal protein L39e  51.16 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1884  50S ribosomal protein L39e  50 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.225461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0538  50S ribosomal protein L39e  52.27 
 
 		 50 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00000680547  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1000  50S ribosomal protein L39e  52.38 
 
 		 50 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1480  50S ribosomal protein L39e  50 
 
 		 50 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000000312587  hitchhiker  0.000439629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>