36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05427 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_05427  ISxac1 transposase  100 
 
 
107 aa  213  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03794  ISxac1 transposase  90.65 
 
 
189 aa  186  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01801  ISXoo8 transposase  91.59 
 
 
407 aa  184  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05638  ISXoo8 transposase  92.52 
 
 
407 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04334  ISXoo8 transposase  92.52 
 
 
407 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01507  ISXoo8 transposase  92.52 
 
 
407 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01863  ISXoo8 transposase  92.52 
 
 
407 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02154  ISXoo8 transposase  92.52 
 
 
407 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775985  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03192  ISXoo8 transposase  92.52 
 
 
407 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00634  ISXoo8 transposase  91.59 
 
 
407 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03705  ISxac1 transposase  93.46 
 
 
107 aa  178  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04657  ISXoo8 transposase  90.65 
 
 
407 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.18331  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02581  ISXoo8 transposase  88.79 
 
 
404 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1658  transposase, IS4 family protein  32.08 
 
 
220 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196092  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  32.08 
 
 
400 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 
400 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  32.08 
 
 
400 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1916  transposase IS4 family protein  32.08 
 
 
400 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.511256  normal  0.075627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3303  transposase IS4 family protein  46 
 
 
397 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1976  transposase IS4 family protein  46 
 
 
397 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00982369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1603  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0820  transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00771423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4558  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3181  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3046  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2715  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1590  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0524  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0337  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4716  transposase (IS4 family)  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2541  IS10, transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2795e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4777  IS10 transposase  34.67 
 
 
402 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271469  normal  0.676926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2015  transposase IS4 family protein  44 
 
 
397 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3793  transposase IS4 family protein  44 
 
 
397 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45960  Transposase, IS4  36.89 
 
 
397 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05564  hypothetical protein  30.77 
 
 
397 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>