30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5880 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5880  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67940  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  217  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399454  hitchhiker  0.00937043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04550  hypothetical protein  76.52 
 
 
132 aa  185  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0103  GCN5-related N-acetyltransferase  46.23 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0097  GCN5-related N-acetyltransferase  43.88 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0520  hypothetical protein  39.8 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3669  acetyltransferase  37.76 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0287377  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3975  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0227  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0243  acetyltransferase  35.35 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3213  hypothetical protein  37.63 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.432533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3757  acetyltransferase, gnat family  36.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3877  GNAT family acetyltransferase  36.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3834  acetyltransferase, gnat family  36.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.527469  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3768  acetyltransferase, gnat family  36.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3936  GNAT family acetyltransferase  36.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3873  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
143 aa  48.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.733855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4778  acetyltransferase, GNAT family  34.69 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0256  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3940  acetyltransferase  34.69 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3862  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
127 aa  43.5  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3863  acetyltransferase, GNAT family  34.69 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3742  acetyltransferase  34.69 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3658  acetyltransferase  34.69 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03261  hypothetical protein  34.69 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03308  hypothetical protein  34.69 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
278 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>