26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3213 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  286  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.432533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3940  acetyltransferase  33.81 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4778  acetyltransferase, GNAT family  33.81 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0256  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03261  hypothetical protein  33.81 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3936  GNAT family acetyltransferase  29.5 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3768  acetyltransferase, gnat family  29.5 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3757  acetyltransferase, gnat family  29.5 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3877  GNAT family acetyltransferase  29.5 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3834  acetyltransferase, gnat family  29.5 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.527469  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03308  hypothetical protein  33.81 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3658  acetyltransferase  33.81 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3975  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255915  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3669  acetyltransferase  34.17 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0287377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3863  acetyltransferase, GNAT family  33.58 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0243  acetyltransferase  34.43 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3862  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3742  acetyltransferase  31.65 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0227  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5880  hypothetical protein  37.63 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0097  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0520  hypothetical protein  32.63 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0103  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67940  hypothetical protein  34.41 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399454  hitchhiker  0.00937043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04550  hypothetical protein  38.2 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>