29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_67940  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399454  hitchhiker  0.00937043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5880  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  235  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04550  hypothetical protein  75 
 
 
132 aa  183  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0103  GCN5-related N-acetyltransferase  44.76 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0097  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0520  hypothetical protein  38.78 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0227  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3669  acetyltransferase  37.25 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0287377  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3975  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255915  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0243  acetyltransferase  35.71 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3936  GNAT family acetyltransferase  36.63 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3768  acetyltransferase, gnat family  36.63 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3834  acetyltransferase, gnat family  36.63 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.527469  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3877  GNAT family acetyltransferase  36.63 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3757  acetyltransferase, gnat family  36.63 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3213  hypothetical protein  36.56 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.432533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3862  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  34.96 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4778  acetyltransferase, GNAT family  35.29 
 
 
127 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0256  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
127 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3940  acetyltransferase  35.71 
 
 
127 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3863  acetyltransferase, GNAT family  35.29 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3742  acetyltransferase  35.71 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03261  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3658  acetyltransferase  35.29 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03308  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3873  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.733855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>