50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4316 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4316  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  347  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50650  hypothetical protein  95.38 
 
 
173 aa  332  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0336364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1448  GCN5-related N-acetyltransferase  64.15 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0935976  normal  0.790583 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.46 
 
 
149 aa  47.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0286  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3659  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
143 aa  45.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4431  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110748  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  30.61 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  31.68 
 
 
148 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4649  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33490  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  39.13 
 
 
315 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4973  GCN5-like N-acetyltransferase  41.54 
 
 
175 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000872655  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0409  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  32.26 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0194  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  32.95 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.37 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  24 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17430  acetyltransferase  38.83 
 
 
317 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0493  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
170 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.691777 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0773  hypothetical protein  31.93 
 
 
201 aa  42  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208077  normal  0.373974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
399 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.21 
 
 
148 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
153 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1525  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
169 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1720  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
169 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.547473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.89212  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3493  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.85 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4121  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
178 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  26.36 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
414 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
400 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
414 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1975  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
205 aa  41.2  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
153 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1749  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0672  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.682973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1451  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
174 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2181  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  34.07 
 
 
295 aa  40.8  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
175 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>