18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0679 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0679  putative transcripton factor  100 
 
 
257 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07321  putative transcripton factor  95.72 
 
 
257 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07341  putative transcripton factor  94.94 
 
 
257 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.348499  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07521  putative transcripton factor  75.21 
 
 
254 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07941  putative transcripton factor  50.78 
 
 
288 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0101021 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1455  putative transcripton factor  43.75 
 
 
285 aa  267  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07391  putative transcripton factor  48.98 
 
 
296 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0113  putative transcripton factor  48.57 
 
 
296 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142539  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1045  putative transcripton factor  44.62 
 
 
262 aa  261  8e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0714835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15621  putative transcripton factor  44.72 
 
 
256 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.766626 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4496  metallophosphoesterase  34.72 
 
 
307 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4432  metallophosphoesterase  34.72 
 
 
307 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3029  metallophosphoesterase  33.71 
 
 
300 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.901725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1990  metallophosphoesterase  32.45 
 
 
309 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0269  metallophosphoesterase  28.94 
 
 
314 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00378904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4150  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
310 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.774048  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1897  putative transcripton factor DevT-like  30.12 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00338637  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2908  metallophosphoesterase  31.2 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>