20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1990 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1990  metallophosphoesterase  100 
 
 
309 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2908  metallophosphoesterase  79.67 
 
 
300 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4150  metallophosphoesterase  63.93 
 
 
310 aa  414  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.774048  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4496  metallophosphoesterase  61 
 
 
307 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4432  metallophosphoesterase  61 
 
 
307 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3029  metallophosphoesterase  59.53 
 
 
300 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.901725 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0269  metallophosphoesterase  54.76 
 
 
314 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00378904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1897  putative transcripton factor DevT-like  50.87 
 
 
296 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00338637  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07941  putative transcripton factor  35.59 
 
 
288 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0101021 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1455  putative transcripton factor  35.17 
 
 
285 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15621  putative transcripton factor  37.17 
 
 
256 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.766626 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0113  putative transcripton factor  34.47 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142539  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07391  putative transcripton factor  34.24 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1045  putative transcripton factor  34.7 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0714835  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07321  putative transcripton factor  33.21 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0679  putative transcripton factor  32.45 
 
 
257 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07341  putative transcripton factor  33.33 
 
 
257 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.348499  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07521  putative transcripton factor  34.78 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3964  metallophosphoesterase  26.1 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  normal  0.285649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3584  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
258 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>