18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0113 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0113  putative transcripton factor  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142539  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07391  putative transcripton factor  98.31 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07941  putative transcripton factor  62.77 
 
 		 288 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0101021 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15621  putative transcripton factor  58.57 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.766626 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1455  putative transcripton factor  51.8 
 
 		 285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1045  putative transcripton factor  54.55 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0714835  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07521  putative transcripton factor  51.67 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07341  putative transcripton factor  48.41 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.348499  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0679  putative transcripton factor  47.62 
 
 		 257 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07321  putative transcripton factor  47.62 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4496  metallophosphoesterase  38.05 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4432  metallophosphoesterase  38.05 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3029  metallophosphoesterase  36.3 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.901725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4150  metallophosphoesterase  37.11 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.774048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1990  metallophosphoesterase  34.47 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0269  metallophosphoesterase  34.47 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2908  metallophosphoesterase  34.9 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1897  putative transcripton factor DevT-like  37.33 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00338637  normal  0.506208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>