14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58171 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_58171  predicted protein  100 
 
 
385 aa  782    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.344003 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11071  SGT1 and CS domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G04090)  29.61 
 
 
540 aa  159  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.041642  normal  0.713471 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02300  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 
235 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11363  predicted protein  29.8 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4906  predicted protein  32.5 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0293867  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06310  conserved hypothetical protein  32.22 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
533 aa  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  30.08 
 
 
369 aa  46.2  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
301 aa  46.2  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
458 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0984  heat shock protein DnaJ-like  31.46 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000336524  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 
833 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1251  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15331  hypothetical protein  27.92 
 
 
557 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>