14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56516 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_56516  F1-ATP synthase assembly protein  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.471375  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09062  mitochondrial molecular chaperone (Atp12), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02490)  33.45 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488866  normal  0.0529685 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03060  hypothetical protein  31.8 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43255  predicted protein  26.77 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.917305 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50559  predicted protein  24.41 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1017  ATP12 ATPase  28.39 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388944  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2504  ATP12 ATPase  22.09 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0317  ATP12 chaperone protein  29.5 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2656  ATP12 ATPase  24.41 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.924505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1704  ATP12 ATPase  43.55 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2263  hypothetical protein  34.44 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0293  ATP12 ATPase  32.32 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.553386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0853  ATP12 ATPase  30 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.344242  decreased coverage  0.000239957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0792  ATP12 ATPase  29.5 
 
 		 236 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>