16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29844 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_29844  predicted protein  100 
 
 		 540 aa  1104    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300774  normal  0.114506 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02250  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  31.06 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470976  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02876  autophagy-related protein Atg22B2 (Eurofung)  21.38 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07591  Autophagy-related protein 22-2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVT9]  18.45 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  21.29 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00360  conserved hypothetical protein  20.59 
 
 		 483 aa  53.9  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07437  Autophagy-related protein 22-1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW93]  18.04 
 
 		 588 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0083743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05876  autophagy-related protein Atg22B1 (Eurofung)  29.03 
 
 		 518 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.956901  normal  0.513042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  21.36 
 
 		 448 aa  50.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  23 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 436 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  20.71 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  28.41 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>