10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46805 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46805  predicted protein  100 
 
 
383 aa  793    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44046  predicted protein  25.74 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48422  predicted protein  29.65 
 
 
702 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50133  predicted protein  25.51 
 
 
629 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.157977  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43354  predicted protein  24.4 
 
 
909 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648253  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43862  predicted protein  25.14 
 
 
632 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.01884  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43027  predicted protein  22.16 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.256203  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48255  predicted protein  41.1 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00746929  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  24.15 
 
 
811 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  25.1 
 
 
865 aa  46.2  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>