22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52058 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_54688  predicted protein  48.26 
 
 
1027 aa  697    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_52058  predicted protein  100 
 
 
867 aa  1797    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16379  predicted protein  43.32 
 
 
769 aa  624  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191953  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40911  predicted protein  41.45 
 
 
1453 aa  582  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844333  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_432  predicted protein  40.74 
 
 
867 aa  550  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08862  Aspergillus nidulans myosin V homolog (Eurofung)  36.75 
 
 
1569 aa  501  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04706  myosin II homolog (Eurofung)  39.07 
 
 
2404 aa  476  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75361  Myosin-2 (Class V unconventional myosin MYO2) (Type V myosin heavy chain MYO2) (Myosin V MYO2)  33.65 
 
 
1571 aa  472  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120834 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66079  Myosin-1 (Type II myosin)  36.53 
 
 
1874 aa  439  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.549994 
 
 
-
 
NC_006686  CND05780  MYO2-related  36.2 
 
 
1576 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06470  nonmuscle myosin heavy chain b, putative  35.2 
 
 
1625 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347127  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51848  predicted protein  33.72 
 
 
932 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_292  predicted protein  34.31 
 
 
763 aa  409  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01558  Myosin-1 (Class I unconventional myosin)(Type I myosin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00647]  34.75 
 
 
1249 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.294157  normal  0.0868257 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25867  predicted protein  32.02 
 
 
804 aa  369  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79258  Myosin-5 isoform  32.56 
 
 
1256 aa  340  9e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04540  microfilament motor, putative  32.41 
 
 
1274 aa  335  3e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01610  chitin synthase-related  27.56 
 
 
1895 aa  187  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06318  Chitin synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13281]  22.22 
 
 
1852 aa  94.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15619  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06317  Chitin synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2L6A0]  25.42 
 
 
1739 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45710  predicted protein  31.11 
 
 
890 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.262092  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47243  predicted protein  31.11 
 
 
850 aa  44.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>