14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49046 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49046  predicted protein  100 
 
 
454 aa  946    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208062  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50451  predicted protein  25.69 
 
 
688 aa  84  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  31.01 
 
 
289 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  28.37 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  24.63 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36557  predicted protein  28.71 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.325381  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  25.48 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  28.47 
 
 
279 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  25.97 
 
 
300 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  25.97 
 
 
300 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  28.08 
 
 
279 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  26.8 
 
 
279 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  27.95 
 
 
279 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  29.91 
 
 
1082 aa  43.5  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>