21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47970 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47970  predicted protein  100 
 
 		 322 aa  661    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000220023  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0691  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.27 
 
 		 119 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1619  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.64 
 
 		 117 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0812  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  32.14 
 
 		 115 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0800  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.5 
 
 		 117 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429736  normal  0.563113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.5 
 
 		 117 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3081  peptidylprolyl isomerase  32.37 
 
 		 115 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114417  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0784  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.22 
 
 		 117 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.496547  normal  0.152176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2212  putative FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)(immunophilin) protein  31.65 
 
 		 117 aa  46.2  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724814  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3469  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.2 
 
 		 114 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1714  Peptidylprolyl isomerase  30.77 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.326907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1971  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.66 
 
 		 117 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000000187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.25 
 
 		 117 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236785 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2612  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.06 
 
 		 113 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0907  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.06 
 
 		 113 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0554  FK506-binding protein  27.66 
 
 		 113 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4527  peptidylprolyl isomerase  28.06 
 
 		 113 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3836  peptidylprolyl isomerase  28.06 
 
 		 113 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.01461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17131  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  28.16 
 
 		 184 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.638563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3689  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.06 
 
 		 113 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2261  peptidylprolyl isomerase  28.06 
 
 		 113 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238046  normal  0.0302474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>