13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42887 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42887  predicted protein  100 
 
 
374 aa  783    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0365267  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49501  predicted protein  45.2 
 
 
439 aa  330  3e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183767  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37270  predicted protein  44.09 
 
 
387 aa  316  5e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000276277  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47140  predicted protein  42.56 
 
 
375 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45614  predicted protein  43.06 
 
 
386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164661  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49454  predicted protein  44.1 
 
 
350 aa  276  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47497  predicted protein  33.04 
 
 
398 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49991  predicted protein  28.18 
 
 
448 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00000460754  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49053  predicted protein  30.39 
 
 
688 aa  116  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.377912  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44255  predicted protein  27.97 
 
 
397 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37714  predicted protein  30.77 
 
 
269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40895  predicted protein  29.05 
 
 
365 aa  107  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44272  predicted protein  25.62 
 
 
403 aa  99.8  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.297301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>