23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1473 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_1473  predicted protein  100 
 
 
476 aa  976    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.179281  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69919  predicted protein  24.85 
 
 
861 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.634298  normal  0.0404263 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39402  early-response-to-dehydration protein  24.4 
 
 
790 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.567255  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10056  DUF221 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02130)  22.74 
 
 
834 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.394363  normal  0.636169 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72010  predicted protein  24.25 
 
 
895 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.355698 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01070  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 
861 aa  107  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.935111  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08069  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 
854 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43394  predicted protein  27.52 
 
 
1071 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560278  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81786  Uncharacterized conserved protein  21.73 
 
 
854 aa  100  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.773258  normal  0.0807232 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02880  DUF221 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11660)  22.33 
 
 
1033 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.157332 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53781  predicted protein  20.5 
 
 
878 aa  94.4  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236699  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00229  DUF221 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10920)  26.16 
 
 
875 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.411379 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36310  predicted protein  26.91 
 
 
882 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.278303  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36312  predicted protein  25.59 
 
 
740 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00980  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 
1010 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58118  predicted protein  23.14 
 
 
878 aa  84.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.840307  normal  0.938716 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43772  predicted protein  27.56 
 
 
1013 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06071  DUF221 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09070)  26.21 
 
 
1196 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218843  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00690  hypothetical protein  22.34 
 
 
1029 aa  74.3  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.218688  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00640  membrane protein, putative  21.53 
 
 
988 aa  67.4  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29234  predicted protein  28.83 
 
 
1307 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01000  hypothetical protein  21.36 
 
 
597 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.77991  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28050  predicted protein  21.95 
 
 
1024 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0618861  normal  0.0695266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>