23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12379 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12379  predicted protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22819  predicted protein  45.25 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134884  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31436  predicted protein  30.22 
 
 		 238 aa  92.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0440287  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8963  predicted protein  28.18 
 
 		 226 aa  91.3  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.66909  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15699  predicted protein  28.65 
 
 		 228 aa  85.9  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0359355  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16592  predicted protein  29.44 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00540575  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30479  predicted protein  29.89 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15341  predicted protein  28.57 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0601041  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12262  predicted protein  26.55 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06860  hypothetical protein  26.7 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05590  hypothetical protein  26.07 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47064  predicted protein  25 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.131111 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7358  predicted protein  26.36 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_8121  predicted protein  25.42 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300173  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01247  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10340)  22.12 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72814  predicted protein  22.22 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.146555 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03412  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01470)  25.57 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.926625 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00731  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13840)  25.76 
 
 		 305 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47402  predicted protein  22.96 
 
 		 330 aa  48.5  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335962  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31437  predicted protein  25 
 
 		 233 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.042699  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16632  predicted protein  21.58 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0983829  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06626  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03910)  22 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.455126  normal  0.687506 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09290  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.297037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>