14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_72814 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_72814  predicted protein  100 
 
 
244 aa  509  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.146555 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47064  predicted protein  39.56 
 
 
198 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.131111 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06860  hypothetical protein  27.98 
 
 
189 aa  79  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01247  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10340)  25 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30479  predicted protein  25.11 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12262  predicted protein  28.57 
 
 
177 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03412  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01470)  26.79 
 
 
202 aa  55.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.926625 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12379  predicted protein  22.22 
 
 
179 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22819  predicted protein  27.31 
 
 
185 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134884  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15341  predicted protein  23.81 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0601041  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27860  predicted protein  26.09 
 
 
409 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.572712  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47402  predicted protein  20.85 
 
 
330 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335962  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06626  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03910)  20.55 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.455126  normal  0.687506 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16632  predicted protein  35.29 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0983829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>