16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1436 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1436  ATPase, putative  100 
 
 
672 aa  1371    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.120762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3659  ATPase, putative  36.44 
 
 
667 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0800074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3858  hypothetical protein  28.38 
 
 
680 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611595  normal  0.0467338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4842  hypothetical protein  29.17 
 
 
680 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4930  hypothetical protein  29.17 
 
 
680 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6973  hypothetical protein  31.05 
 
 
683 aa  253  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000276494  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0935  hypothetical protein  27.79 
 
 
646 aa  219  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.002395  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2309  hypothetical protein  26.63 
 
 
666 aa  214  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.444355  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52360  hypothetical protein  25.47 
 
 
665 aa  170  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3861  hypothetical protein  22.82 
 
 
700 aa  77  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3190  hypothetical protein  23.58 
 
 
708 aa  67.8  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201258  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3789  hypothetical protein  38.37 
 
 
106 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0120115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1497  histidine kinase  24.21 
 
 
621 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00383985  normal  0.0346949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1178  hypothetical protein  36.75 
 
 
629 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0305032  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3557  hypothetical protein  36.75 
 
 
629 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0398758  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0229  ATPase family protein  37.06 
 
 
626 aa  47.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00298001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>