12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3858 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4842  hypothetical protein  70.88 
 
 		 680 aa  1001    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4930  hypothetical protein  70.88 
 
 		 680 aa  1001    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3858  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1388    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611595  normal  0.0467338 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6973  hypothetical protein  31.49 
 
 		 683 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000276494  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_002950  PG1436  ATPase, putative  28.38 
 
 		 672 aa  259  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.120762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2309  hypothetical protein  29.84 
 
 		 666 aa  246  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.444355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0935  hypothetical protein  29.79 
 
 		 646 aa  240  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.002395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3659  ATPase, putative  27.5 
 
 		 667 aa  230  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0800074  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52360  hypothetical protein  28.61 
 
 		 665 aa  221  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3190  hypothetical protein  23.94 
 
 		 708 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3861  hypothetical protein  23.75 
 
 		 700 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0229  ATPase family protein  21.82 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00298001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>