21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3582 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3582  FeoA family protein  100 
 
 
73 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1077  hypothetical protein  50.7 
 
 
74 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1801  FeoA family protein  49.28 
 
 
83 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1829  FeoA family protein  49.28 
 
 
83 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  44.29 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2442  Iron dependent repressor:FeoA  41.67 
 
 
214 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.681497  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  41.67 
 
 
214 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  41.67 
 
 
214 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.48 
 
 
214 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.48 
 
 
214 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.58 
 
 
217 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  38.81 
 
 
218 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2999  iron dependent repressor  41.67 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3941  hypothetical protein  38.24 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.02303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05930  Ferrous iron transport protein FeoA  30 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0793169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.92 
 
 
225 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  33.33 
 
 
225 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.92 
 
 
225 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  40.91 
 
 
224 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  35.71 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1623  FeoA family protein  37.14 
 
 
84 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>