16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3941 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3941  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  205  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.02303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1801  FeoA family protein  45 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1829  FeoA family protein  45 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3582  FeoA family protein  38.24 
 
 
73 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  34.78 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  35.71 
 
 
219 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.76 
 
 
214 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  36.23 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1341  FeoA family protein  44 
 
 
50 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.760539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1077  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2442  Iron dependent repressor:FeoA  35.29 
 
 
214 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.681497  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  36.76 
 
 
214 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05930  Ferrous iron transport protein FeoA  32.84 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2999  iron dependent repressor  33.82 
 
 
214 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000263786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>