12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3023 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3023  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2757  hypothetical protein  53.03 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.088945  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2929  hypothetical protein  56.06 
 
 
208 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1592  hypothetical protein  48.48 
 
 
198 aa  63.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2847  hypothetical protein  45.45 
 
 
205 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0646  hypothetical protein  46.97 
 
 
205 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0666  hypothetical protein  46.97 
 
 
205 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1983  hypothetical protein  45.45 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.428764  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1959  hypothetical protein  46.97 
 
 
207 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95171  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4574  hypothetical protein  47.76 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2967  hypothetical protein  40.91 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586657  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5292  hypothetical protein  41.79 
 
 
206 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>