17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1403 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1403  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  306  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4691  hypothetical protein  76.69 
 
 
135 aa  216  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220127  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4834  hypothetical protein  68.66 
 
 
139 aa  199  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0531  hypothetical protein  70.59 
 
 
139 aa  199  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  37.93 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4269  hypothetical protein  34.78 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.237355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2085  hypothetical protein  36.44 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00513635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  36.75 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  33.91 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1258  hypothetical protein  32.03 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1222  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28058  predicted protein  27.94 
 
 
340 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00100512  normal  0.0736685 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42477  predicted protein  37.31 
 
 
332 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49656  predicted protein  27.86 
 
 
399 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309902  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_10591  predicted protein  24.04 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120478  normal  0.660881 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29864  predicted protein  25.69 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>