22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0123 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0123  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.142779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2809  hypothetical protein  69.46 
 
 
201 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3308  hypothetical protein  69.46 
 
 
201 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4459  hypothetical protein  49.13 
 
 
168 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  27.71 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  25.85 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  27.14 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  26.59 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  27.06 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  27.17 
 
 
189 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  25.15 
 
 
214 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  25.75 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  23.53 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  25.7 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  24.56 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  25.73 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  22.81 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  24.55 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  23.08 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  23.08 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  23.08 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  24.85 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.404272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>