21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3308 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2809  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3308  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0123  hypothetical protein  69.46 
 
 
201 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.142779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4459  hypothetical protein  48 
 
 
168 aa  178  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  22.82 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  24.04 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  26.16 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  26.97 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  25 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  22.54 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  25.36 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  25 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  26.47 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  26.47 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  24.55 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  26.06 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  26.35 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  23.53 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  26.89 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  24.56 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  24.42 
 
 
271 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>