18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3584 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3584  SecA regulator SecM  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000493767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3772  SecA regulator SecM  97.08 
 
 		 174 aa  326  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000343776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0618  SecA regulator SecM  58.68 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000184005  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3379  SecA regulator SecM  55.8 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000979171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2910  SecA regulator SecM  55.8 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000125049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0643  SecA regulator SecM  52.07 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00070742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3560  SecA regulator SecM  51.41 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000353856  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00097  hypothetical protein  51.41 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000224196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00098  SecA regulator SecM  51.41 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00024952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0105  SecA regulator SecM  52 
 
 		 195 aa  154  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000103952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0099  SecA regulator SecM  51.43 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0103  SecA regulator SecM  51.43 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000264126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3503  secretion monitor family proten  51.43 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0102  SecA regulator SecM  52 
 
 		 195 aa  153  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000627465  normal  0.544351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0091  SecA regulator SecM  49.42 
 
 		 195 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0769  SecA regulator SecM  52.87 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000285122  normal  0.361912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0656  SecA regulator SecM  53.79 
 
 		 144 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3510  SecA regulator SecM  49.37 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000122858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>