168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2087 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
162 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  80.75 
 
 
162 aa  278  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1502  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1043  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
157 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1244  acetyltransferase protein  36.91 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1144  acetyltransferase  33.33 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5365  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5495  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00452023  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4776  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
316 aa  67.8  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773188  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5375  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173903  normal  0.430814 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1754  acetyltransferase  31.01 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2170  acetyltransferase  31.65 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4829  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0857  acetyltransferase  31.01 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1146  acetyltransferase  31.01 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0401  acetyltransferase  31.01 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0312  acetyltransferase  31.01 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2121  acetyltransferase  31.01 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0161  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0947  acetyltransferase  26.92 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0084  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1853  acetyltransferase  31.58 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0961913  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277179  normal  0.0503252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3055  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201738  normal  0.142362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4561  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.02 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.8 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  37 
 
 
270 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1878  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410863  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0942  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.8 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.8 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.8 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.8 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.8 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11650  sortase-like acyltransferase  32.28 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.359043  normal  0.185087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.8 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.8 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
312 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.8 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2180  acetyltransferase, GNAT family  32.1 
 
 
295 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2071  acetyltransferase, GNAT family  32.22 
 
 
289 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  30.12 
 
 
295 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  30.12 
 
 
295 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3234  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
295 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.157565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0081  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0306136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  30.86 
 
 
295 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2158  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.82 
 
 
168 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0157524 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  29.63 
 
 
295 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.94 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  25 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.02 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
299 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000582767  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0831  putative acetyltransferase  26.36 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.591066  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0741  putative acetyltransferase  27.94 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.871349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1342  acetyltransferase  29.73 
 
 
264 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0732306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1778  acetyltransferase  30.77 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357267  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1153  acetyltransferase domain-containing protein  29.73 
 
 
264 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
173 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2165  acetyltransferase  31.94 
 
 
90 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.260654  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.44 
 
 
167 aa  47.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.22 
 
 
195 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
183 aa  47.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1941  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0958  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.72 
 
 
173 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0193  GCN5-related N-acetyltransferase  24.58 
 
 
147 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.32 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0044  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  29.59 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.48 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3283  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.29 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.33549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.44 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0126129  hitchhiker  0.000306087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3325  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3461  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.1 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.26 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3430  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
183 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.137852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1048  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.070791  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4290  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  32.88 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.945027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>