13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1608 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1608  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.896444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1707  hypothetical protein  97.58 
 
 		 124 aa  246  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3887  hypothetical protein  59.78 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1744  hypothetical protein  45.08 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2900  hypothetical protein  44.8 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2944  hypothetical protein  43.2 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2919  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2080  hypothetical protein  42.74 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377001  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6821  lipoprotein  32.79 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1517  lipoprotein  31.25 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6290  hypothetical protein  29.81 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00692332  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5730  lipoprotein  32.43 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.213554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2470  hypothetical protein  36.92 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.039072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>