15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6821 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6821  lipoprotein  100 
 
 
132 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1517  lipoprotein  48.21 
 
 
134 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2900  hypothetical protein  34.43 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2919  putative lipoprotein  35.16 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2944  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1608  hypothetical protein  32.79 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.896444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1707  hypothetical protein  35.64 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1744  hypothetical protein  31.53 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3887  hypothetical protein  39.78 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2080  hypothetical protein  27.87 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377001  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6290  hypothetical protein  32.71 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00692332  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5455  hypothetical protein  29.29 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2470  hypothetical protein  46.67 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.039072  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5730  lipoprotein  33.33 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.213554  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5064  hypothetical protein  28.16 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0282411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>