15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2919 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2919  putative lipoprotein  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2944  hypothetical protein  70.87 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2900  hypothetical protein  64.84 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1608  hypothetical protein  45.45 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.896444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1707  hypothetical protein  44.63 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3887  hypothetical protein  46.24 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1744  hypothetical protein  37.7 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2080  hypothetical protein  36.22 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377001  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6821  lipoprotein  35.16 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1517  lipoprotein  38.05 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6290  hypothetical protein  26.19 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00692332  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5455  hypothetical protein  23.16 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0957  hypothetical protein  33.01 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459969  decreased coverage  0.000000000276265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 55 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0902787  hitchhiker  0.00000000000988201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5730  lipoprotein  29.67 
 
 		 121 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.213554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>