11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42450  translocator protein PopB  100 
 
 		 390 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0030  translocator protein YopB  43.06 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.556106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01741  hypothetical protein  46.42 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003377  type III secretion host injection protein (YopB)  47.81 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1511  translocation machinery component  26.34 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.119041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1496  translocation machinery component  26.34 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1533  translocation machinery component  25.81 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1943  translocation machinery component  25.81 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.319033  normal  0.78715 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5050  EspD  28.26 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3000  type III secretion system target, YopB family  25.51 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.328389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1773  translocation machinery component  23.66 
 
 		 484 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>